使用无污染的移液器能确保准确性，因此每次使用前后必须确保移液器清洁。
日常只需清洁移液器的外表面即可，操作如下:

1 拆除移液器中的安全圆锥过滤器
2 使用柔软的无纺布蘸取消毒液或中性清洁剂轻轻擦拭移液器的表面
3 用蘸取纯水（3级）或蒸馏水的湿布底清除移液器上的所有清洁剂然后擦干
4 将新的安全圆锥过滤器安装在移液器上
 
 

清洁是指去除移液器上的一切异物，如灰尘、核酸、蛋白质、缓冲液和盐。
去污是指去除或杀死病毒、细菌和真菌等微生物。此外还涉及化学品和放射性物质的去除或中和。
移液器的下半部分要根据使用情况及时清洁和去污，建议每3个月清洁一次, 操作如下:
 
1 参阅移液器用户手册，查看移液器清洁或去污方案及所选清洁溶剂的化学兼容性
2 戴上手套，拆下移液器下半部分部件
3 使用所选的清洁剂底清洁移液器的下半部分部件，并擦拭移液器手柄的外部
4 使用纯水（3 级）或蒸馏水底清除移液器上残留的清洁溶剂
5 重新润滑移液器
6 移液器的维护和性能测试可外包给服务供应商
 
为了底清洁和去污，还可对移液器进行高压灭菌，操作如下：
 
1 取下安全圆锥过滤器
2 确认可高压灭菌的部件
3 将移液器或部件放入灭菌袋，然后置于高压灭菌锅内
4 在121℃和1 bar的高压下灭菌20分钟
5 冷却并晾干相关部件
6 安装新的圆锥过滤器
7 重新组装移液器并进行性能检查